Maghiarii,trecuti la protestantism in marea lor majoritate,au repins atat catolicismul cat si centralizarea habsburgica si au pornit o rascoala antiimperiala sub conducerea lui Francisc II Rakoczy.Dar miscarea, care a beneficiat de o participare romaneasca larga, a fost infranta, iar pacea de la Satu Mare (1711) a marcat instaurarea definitiva a regimului Casei de Austria in Transilvania .
Unirea bisericii ortodoxe cu cea catolica,relizata practic in 1701 , se limita la recunoasterea a trei puncte dogmatice si la primatul papei.Biserica rezultata , numita greco-catolica,urma sa-si pastreze neschimbat ritul,calendarul,sarbatorile si canonele ortodoxe.Impotriva unirii cu Roma s-a ridicat calugarul de origine sarba Visarion Sarai care a produs un reviriment al ortodoxiei in zonele Hunedoara si Sibiu.
Pentru romanii din Transilvania , conditiile unirii s-au transformat in revendicaricu caracter politic: ei au cerut sa le fie recunoscuta egalitatea in drepturi cu celelalte natiuni componente ale principatului si dreptul de a ocupa functii politice si administrative in stat.in relitate insa, romanii au ramas in continuare o natiune tolerata.Inochentie Micu, episcopul unit al romanilor, a incercat sa foloseasca evenimentele ca un argument al luptei sale.In 1744, Sinodul de la Blaj a amenintat ca daca revendicarile romanesti nu aveau sa fie satisfacute, unirea cu Biserica catolica avea sa fie abandonata.Dar Micu-Klein, initiatorul luptei politice a romanilor din Transilvania , cel care i-a fixat programul si argumentarea istorica, a fost inlaturat in 1744.